A l'herbari BCN es conserven uns 64.000 espècimens de briòfits, la majoria provinents dels Països Catalans i especialment dels Pirineus. Les mostres, assecades i premsades, es guarden en sobres de paper amb l'etiqueta corresponent i fixats sobre un plec d'herbari. Els plecs es guarden en capses de cartró folrades, ordenades per molses i hepàtiques, i dins d'aquests dos grups per gèneres.
Una part de l'herbari de briòfits prové de l'antic herbari de la Facultat de Ciències (BCC), de manera que la major part de les mostres estan numerades com a tals. L'any 2017 s'hi va incorporar l'herbari de briòfits de la Universitat Autònoma de Barcelona (BCB) mitjançant un conveni de cessió signat amb aquesta universitat. Conté uns 60.000 exemplars i és l'herbari de briòfits més important de la Península Ibèrica. Inclou les recol·leccions de la Dra. Creu Casas i les briòlogues de la seva escola. En tots els casos, s'han conservat els números d'herbari i ara es citen com a part de la col·lecció BCN-Bryo, indicant entre parèntesi la seva pertinença original.
La col·lecció de molses està totalment informatitzada i es pot consultar a través de la secció de bases de dades.