A la pàgina web de la Universitat de Bologna hi ha una secció anomenada AMS Historica Tesori delle biblioteche. on podem trobar, en format digital, col·leccions històriques conservades en algunes de les seves biblioteques. Entre elles hi ha una llarga llista amb les obres d'Aldrovandi que es troben a la Biblioteca Universitària.
En el 2005 es va celebrar a Bologna una exposició per commemorar els quatre-cents anys de la mort d'Aldrovandi, organitzada pel Departament de Filosofia i per la Biblioteca Universitària. A l'enllaç “Archivio on line” trobem moltes de les seves obres digitalitzades.
L'herbari d'Aldrovandi, un dels més antics rics i ben conservats d'Europa, el podem trobar digitalitzat a la pàgina web dels Museus de la Universitat de Bologna. Es poden consultar més de cinc mil exemplars de plantes dissecades.