La Cartoteca del CRAI de la Universidad de Barcelona contiene, principalmente, los diferentes fondos cartográficos que se encuentran en los CRAI Bibliotecas de Ciencias de la Tierra, Filosofía, Geografía e Historia, Fondo Antiguo, Pabellón de la República y el Centro de Documentación de Biodiversidad Vegetal (CeDocBiV).
La Cartoteca está formada por la colección de mapas en general, los planos de ciudades, los atlas patrimoniales y todo el material cartográfico antiguo que forma parte del fondo patrimonial del CRAI, entre los que destacamos:
- Los grandes atlas clásicos (Mercator, Blaeu, Ortelius, etc.) y las cartas náuticas y celestes impresas en Europa entre los siglos XVI y principios del XIX, del CRAI Biblioteca de Fondo Antiguo.
- La colección de planos y mapas relacionados con la Guerra Civil y el bombardeo de Barcelona que se encuentran en el CRAI Biblioteca del Pabellón de la República.
- La colección de mapas y planos digitalizados que se encuentran en el CRAI Biblioteca de Filosofía, Geografía e Historia, donde cabe destacar la treintena de mapas que pertenecen al Mapa topográfico nacional de España 1:50.000, editados entre los años 20 y 50.
- La colección de mapas escolares que se encuentran en el CRAI Biblioteca de Filosofía, Geografía e Historia.
- Los mapas temáticos que se pueden consultar a través del CeDocBiV, resultado de los estudios centrados en las comunidades vegetales y del paisaje.
- El conjunto de hojas del Mapa de Cataluña (geológico y topográfico) elaboradas entre los años 1922 y 1941, a escala 1:100 000, a partir de un proyecto iniciado por la Mancomunitat de Cataluña.
Sin embargo, el grueso principal está formado por:
- Cartoteca de Ciencias de la Tierra con un fondo aproximado de 10.000 mapas (de todo el mundo, pero especialmente de Cataluña y de la Península Ibérica) y 14.000 fotografías aéreas de Cataluña y Aragón.
- Cartoteca de Geografía con un fondo aproximado de 16.000 mapas, 9.500 ortofotomapas y 1.000 atlas de todo el mundo, especialmente de Cataluña y España.